Nacio el 7 de octubre 2008, Kirigaya Kazuto fue adoptado por su tía y tío un año después de su nacimiento cuando sus padres biológicos fallecieron en un accidente. Debido a la influencia de su tía como editora de una revista de informática, Kazuto se enamoró de las computadoras y dejó de ir a Kendo después de dos años.
Kazuto tiene una gran habilidad como programador, logrando construir una computadora a partir de piezas durante la escuela primaria, la búsqueda de registros de borrado en el registro nacional a la edad de diez años, así como la gestión para detener el servidor de SAO antes de que suprimieran a Yui mediante la conversión de su programa en un objeto y su almacenamiento en su Nerve Gear como datos ambientales.
Actualmente vive con su familia, aunque su tío no está a menudo a su alrededor. Se crió como su hijo con su prima Suguha Kirigaya como su hermana. Se inició originalmente en Kendo por su abuelo, pero tenía poco interés en este, y como resultado su hermana comenzó a ir a Kendo por él.